為促進物流業健康發展工作，國務院在2009年3月印發《物流業調整和振興規劃》之后，于2011年6月再次召開國務院常務會議，從稅費、過路過橋費等八項政策為物流業減負。作為重要宏觀調控部門，財政部積極落實國務院各項政策要求，降低中間流通成本，支持物流業發展。 
清理違規及不合理收費
2011年6月20日起，財政部聯合相關部門開展了為期一年的收費公路專項清理工作，全面清理公路超期收費、通行費收費標準偏高等違規及不合理收費，堅決撤銷收費期滿的收費項目，取消間距不符合規定的收費站(點)，糾正各種違規收費行為。
“現在明顯感覺到過路過橋費少了，亂收費少了，這塊兒能夠節約成本10%左右。”說起去年以來運輸成本的變化，上海市某物流企業一位畢姓負責人這樣告訴記者。據了解，清理工作開始以后，各地積極清理公路收費項目、撤銷收費站。廣東省自2012年1月起取消了109個普通公路項目收費，撤銷了41個普通公路收費站，減少收費公路里程2664.94公里，全省收費公路占全省公路通車總里程的比例由6.67％下降至5.27％。四川省省共撤銷35個收費站點，停止了1100公里二級公路收費。
上海市自今年1月1日起停止征收貸款道路建設車輛通行費，并將本市高速公路車輛通行費起價從10元調整為5元。“通行費減半后，每個月能夠節省兩三萬塊錢，占企業成本的3%-4%。”上海這位負責人告訴記者。
營業稅改征增值稅
此外，稅收政策也為物流企業帶來利好。為完善增值稅稅制，促進經濟結構調整優化和服務業發展，自2012年1月1日起，國務院在上海市交通運輸業和部分現代服務業開展營業稅改征增值稅試點。在試點實施辦法中，將倉儲、配送和貨運代理明確作為現代服務業，適用6%的低稅率。“原來征收營業稅稅率約為5.7%，盡管6%比原來略高，但改征增值稅后辦公耗材、油費、汽車修理費等可以抵扣，實際稅負還是略有下降。”上述畢姓負責人告訴記者。
采訪中，上述物流企業負責人也談到了部分困難：“一是，油價只漲不跌，政策利好都被油費吃掉了；二是，物流企業的成本過路過橋、油費、人工成本、倉儲、維修費用，辦公耗材較少，希望能夠考慮增加抵扣項，或適當降低增值稅稅率。”
免征蔬菜流通環節增值稅
同樣從2012年1月1日起，財政部出臺《關于免征蔬菜流通環節增值稅有關問題的通知》，對從事蔬菜批發、零售的納稅人銷售的蔬菜免征增值稅。對于蔬菜免征增值稅帶來的實惠，黑龍江省哈市的蔬菜批發公司和大型超市算了筆賬：市民吃到的蔬菜，大概要經過從菜地到批發商再到零售商幾個環節，才能被市民買回家，除生產者(菜農)外，批發商和零售商都將根據經營規模繳納3%或13%的增值稅，增值稅免去后，菜價中若減去增值稅的部分，蔬菜降價會引來更多市民購買，也減輕了批發公司的銷售壓力。
大宗商品倉儲設施用地土地使用稅優惠50%
為落實物流業“新國八條”中關于“完善大宗商品倉儲設施用地的土地使用稅政策”的要求，2012年1月20日，財政部與國稅總局共同出臺《關于物流企業大宗商品倉儲設施用地城鎮土地使用稅政策的通知》（以下稱“通知”）。通知明確，自2012年1月1日起至2014年12月31日止，對物流企業自有的（包括自用和出租）大宗商品倉儲設施用地，減按所屬土地等級適用稅額標準的50%計征城鎮土地使用稅。長江證券評論認為，50%的稅收減免幅度不小，通過減稅能夠支持物流企業獲得更多的運營資金，改善物流企業運營環境，也部分減小物流企業受到的流動性緊縮的沖擊。
通知明確大宗商品倉儲設施為，占地面積在6000平方米以上的，且儲存糧食、棉花、油料等和農業生產資料；煤炭、焦炭、礦砂等礦產品和工業原材料；食品、飲料、藥品、出版物等工業制成品的倉儲設施。倉儲設施用地，包括倉庫庫區內的各類倉房（含配送中心）、油罐（池）、貨場、曬場（堆場）、罩棚等儲存設施和鐵路專用線、碼頭、道路、裝卸搬運區域等物流作業配套設施的用地。
長江證券認為，本次納入大宗商品的范圍基本上包涵了工業生產所需的大部分物料品種，“覆蓋面的廣博側面反映政策的影響范圍不小。”本次的大宗商品名單中，生產物料的入圍要明顯多于終產品的入圍，入圍的生產物料基本覆蓋我國目前實體經濟的主要生產原料，是從物料的入廠端推進整個社會的物流成本降低。另外，扶持倉儲企業運營，也是對實體經濟的間接促進，降低生產物料在流通中的保管費用成本。“基于以上考慮，本次政策的長期意義明顯，對行業的促進作用將在未來與其他政策協同，優化物流業發展環境。”
根據今年的預算報告，今年財政部將穩步擴大營業稅改征增值稅試點范圍，促進服務業特別是現代服務業發展。擴大物流企業營業稅差額納稅試點范圍，完善大宗商品倉儲設施用地城鎮土地使用稅政策，對蔬菜的批發、零售免征增值稅，減輕物流企業和農產品生產流通環節的稅收負擔。