汶川特大地震發(fā)生后，重慶市港航局迅速啟動水路運輸組織應(yīng)急預(yù)案，并及時與三峽通航管理局和湖北省港航局進(jìn)行了協(xié)調(diào)，以保證運輸救災(zāi)物資船舶優(yōu)先通過三峽船閘，運輸救災(zāi)物資車輛優(yōu)先上滾裝船。 
        從5月13日至20日，重慶市港航局已組織協(xié)調(diào)5艘次船舶、11800噸柴油優(yōu)先通過三峽船閘，434輛運輸救災(zāi)物資的車輛優(yōu)先上滾裝船，并免收滾裝車輛運費及各項規(guī)費78萬余元，確保了將油品、疾控車、救護(hù)車、電信工程車、藥品、食品運輸車等物資和車輛盡快中轉(zhuǎn)至四川災(zāi)區(qū)。 
        重慶市郭家沱滾裝碼頭在確保抗震救災(zāi)物資水上“綠色通道”暢通的同時，做到抗震救災(zāi)物資車輛優(yōu)先裝卸，確保其安全及時到達(dá)災(zāi)區(qū)。港航部門免收滾裝碼頭抗震救災(zāi)物資車輛貨港費，提倡滾裝公司優(yōu)惠運輸抗震救災(zāi)物資車輛。 
        重慶市港航局還號召全市水運行業(yè)企業(yè)和廣大干部職工為災(zāi)區(qū)積極捐款，據(jù)不完全統(tǒng)計，截至5月20日，全市水運行業(yè)捐款已超過500萬元。