寶山通往崇明三島的三個碼頭將有各自側重的交通功能，其中吳淞客運中心將來會逐步退出崇明三島的水上運輸。獲悉，寶山區三個碼頭的功能定位均已確定：寶楊路碼頭以客運為主、車渡為輔；石洞口碼頭以車渡為主、客運為輔；吳淞客運站和吳淞客運中心近期保持現狀功能，遠期結合交通需求變化情況逐步退出崇明三島水運交通功能 。