上海，應向國際航運中心的港口和全球著名樞紐港口看齊，發展四通八達的內河和海灣、近海集裝箱運輸網，努力成為大港口經濟腹地集裝箱貨物集疏運的主要通道。　　上海通過內河運輸集裝箱量少的原因，一是內河碼頭泊位設施不配套，缺少裝卸、儲運、分拔集裝箱的場地和貨運站，機械設備吊運集裝箱能力不足；二是內河的貨船、拖輪、駁船能運載集裝箱的內河運輸船很少；三是內河碼頭的管理水平低，缺乏管理集裝箱業務的培訓；四是內河水系一級航道只占3%，四/五級航道占8.7%，內河航道亟需改造、整治、擴建；五是內河港區共有1800余個泊位，大部分是中、小泊位，最大設計靠泊能力的泊位只有3000噸級，等級較低。
　　上海內河航運的能力，遠不適應建成國際航運中心對內河集裝箱的集疏運需求，必須根據航運中心建設的三步設想整治、擴建內河航道和內河集裝箱碼頭泊位。
　　此外，內河運輸要增配大功率拖輪、運載集裝箱的駁船和自行集裝箱專用船舶。
　　具體而言，相關規劃明確，2020年前，在大蘆線航道和趙家溝航道整治好的基礎上，將流經上海市各郊(區)、縣的內河航道整治好，將一級航道里程提高到占上海內河航道總里程的8%—10%，2030年前占到20%，并與江蘇、浙江兩省的主要內河航道接通。
　　此外，內河流域每一個區改造2只集裝箱專用碼頭(每只碼頭2只集箱位泊)，并配齊集箱作業的專用機械設備，擴建集裝箱場地和貨運站。到2030年后，每區擁有內河集箱專用碼頭6個，泊位12個。洋山港集裝箱通過鐵路疏運量在2020年占10%，2030年達20%。