3月28日，針對“全國不收費公路將超96%”的消息，新疆維吾爾自治區交通運輸廳表示，新疆地處偏遠，經濟相對落后，最近幾年內暫不執行取消二級公路收費政策。同時表示，還沒有接到政府還貸二級公路取消收費的通知。 　　當日，接受記者電話采訪的自治區交通運輸廳有關負責人表示，根據國務院的改革精神，政府還貸二級公路收費并不是立即取消，而是逐步有序取消。同時，新疆等西部地區因為經濟發展落后，如果全部由財政來負責二級公路還貸，壓力較大。而東部沿海地區經濟發達，相對困難較少。
　　因此新疆最近幾年內都不會執行國家有關逐步有序取消二級公路收費政策。他同時表示，這也是符合國家有關西部大開發政策精神的。
　　“目前，新疆公路建設正處于大力建設階段，希望得到社會各界的支持。”這位負責人介紹說，目前新疆公路項目建設面臨的最大問題是還債壓力。以2008年為例，全疆應支付公路建設貸款本息49.6億元，其中本金30億元、利息19.7億元，平均每天需支付貸款本息1359萬元。
　　據介紹，到2015年，預計全疆二級公路債務將達500億元至600億元。按照中央與地方六四開的比例，新疆將承擔200億元以上債務，償還還有一定難度。若能爭取到中央優惠政策按照七三開或更高的比例，新疆才完全有能力償還。
　　政府還貸二級公路即以政府為主體，向銀行申請貸款并投資興建的二級公路，基本不包括通過BOT等模式興建的私人投資性質公路。