根據《青海省玉樹災后重建運輸保障方案》，玉樹三年重建物資及生活物資運輸總需求量巨大。為確保玉樹災后重建有力、有序、有效進行，省交通廳堅持優先通行、熱情服務、規范管理的原則，對玉樹災后重建物資運輸車輛開通專用通道，確保重建物資運輸車輛和重建工作用車快速、優先、安全、免費通行我省收費公路。 
(一)明確免費車輛范圍。一是運輸玉樹災后重建物資并合法裝載的貨車、運送援建人員的客車；二是經省玉樹重建現場指揮部批準的單位的工作用車；三是省玉樹重建現場指揮部調派的支援運輸車輛；四是交通運輸部或省人民政府確定的其它抗震救災車輛。 
(二)免費通行憑證。一是運輸政府指令性重建物資的免費車輛，憑道路運輸管理機構簽發的貨物運輸“四聯單”辦理“青海玉樹災后重建物資運輸車輛通行證”。該通行證實行“一車一證，隨車運行，貨證相符，趟次有效”管理。二是經省玉樹重建現場指揮部批準的單位的工作用車、調派的支援運輸車輛憑省玉樹重建現場指揮部屬意見的單位介紹信辦理“青海玉樹災后重建工作車輛通行證”。
(三)持有免費通行憑證的車輛通過收費站時，應主動出示通行證，由收費人員核驗確認后通行。對車證不符、貨證不符的車輛或超過了規定的有效期的車輛，原則上不予免費通行。持有免費通行憑證但超限運輸的車輛，必須據實交納當次車輛通行費。
為了提前做好為玉樹災后重建運輸車輛開通專用通道工作，省交通廳運輸處提前著手制定運輸車輛免征公路通行費管理細則、設計通行證樣式和內容，并于5月15日印制了第一批次10萬份的通行證備用。