2009年，泉州檢驗檢疫部門共檢驗檢疫進口臺灣農產品323批、貨值339.64萬美元，同比分別增長71.8%和113.7%。這表明臺灣農產品正以小額貿易方式呈迅猛增長態勢從泉州口岸登陸。 　　據統計，2009年從泉州進境的臺灣檳榔共104批、183.26噸、貨值28.56萬美元，其進口量已占大陸進口總量的一半。進境臺灣自捕魚107批、3655.32噸、貨值156.06萬美元，主要品種為秋刀魚、魷魚等，其中泉州崇武已成為福建省最大的臺灣自捕魚登陸口岸。進境臺灣甲魚蛋111批、396.9噸,貨值140.6萬美元，其中數量達1億枚，進境量占大陸進口總量的40%。臺灣食用活中華鱉實現首次登陸泉州口岸，共為2112公斤，貨值4224美元。目前，臺灣檳榔、自捕魚、甲魚蛋平均每周六個航次已呈常態化，泉臺農產品貿易在福建省乃至全國范圍的影響已日漸顯現。
　　為進一步促進臺灣農產品通過泉州對臺小額貿易碼頭登陸，泉州檢驗檢疫局本著“同等優先、適當放寬、簡化手續、方便進出”原則，提前介入，主動為對臺貿易公司及臺商提供政策咨詢服務并優先受理報檢，簡化報檢程序，采取快速檢測、快速放行等措施，加快通關放行速度，有效地促進對臺農產品輸入。