2009年北海市累計完成水路客運量75.3萬人，比上一年增長23.39%；旅客周轉量完成6082萬人公里，同比增長21.76%；水路貨運量完成594.1萬噸，同比增長11.25%；貨物周轉量完成66.22億噸公里，比2008年增長28.83%，客貨運輸量創歷史新高。 　　據北海日報報道，2009年，受全球金融危機影響,該市在一季度水路貨運量及貨物周轉量整體同比下滑11.13%和24.42%的嚴峻形勢下，抓住《廣西北部灣經濟區發展規劃》實施這一千載難逢的發展機遇，保持了北海水運經濟的良性發展態勢。
　　同時，北部灣經濟圈周邊城市經濟建設迅猛發展，適合北海水運市場的煤炭、建筑材料等幾大貨物的社會需求保持快速增長，水路貨運量自4月份開始企穩回升并逆勢上揚。其中第4季度創造了歷史之最，共完成水路貨運量185.7萬噸、貨物周轉量21.92億噸公里，同比分別增長61.48%和118.49%。
　　此外，北海市水運企業拓寬經營模式，將運輸和旅游結合在一起，海上旅客運輸亦呈現出良好的發展勢頭。