廣州南沙海關正式掛牌開關，將成為通關現場型和轄區管理型相結合的海關關區，轄區內海關監管點多面廣，從來往港澳小型船舶碼頭到大型國際集裝箱碼頭，從貨柜車檢查場到旅檢客運口岸，從保稅倉到保稅港區等海關業務門類和海關特殊監管區域一應俱全，是廣州海關業務改革和創新先行之地。 
廣州海關負責人透露，南沙海關今后將為南沙港區發展提供7項服務措施。提供電子預歸類、電子預審價和電子物流監控的快速通關、網上付稅、提前報關以及24小時預約通關等便捷通關服務，進一步推進區域通關改革，積極推廣艙單預申報、「屬地申報、口岸驗放」及一關通「艙單互認」等通關監管模式，進一步提高港口貨物集散能力及港區物流輻射能力。 
南沙海關貨運口岸現場將實行「5+2」工作日制度，推行每周預約通關服務，為企業在南沙口岸通關提供更多的便利；支持南沙客運碼頭開通夜航班輪和節假日加班航班，加大客運碼頭的海關人力資源投入，為南沙地區的經貿往來和對外旅游的發展創造更加便利條件。 
另外，支持和促進南沙保稅港區早日通過國家驗收，并提供一體化海關監管服務，以統一的海關監管模式監管港口作業區、出口加工區和保稅物流園區的業務，促進港口物流和保稅物流的無縫對接和高效流轉。