昆明市貨運發票在全省貨運發票認證量最大，為解決納稅人在辦稅服務廳窗口認證貨運發票時間較長、認證效率低等問題，昆明市國稅局決定自2008年8月起在全市推行貨運發票網上認證，充分利用信息技術手段方便增值稅一般納稅人認證貨運發票，提高貨運發票抵扣聯信息采集效率與質量，優化和完善納稅服務。 
　　網上認證是指納稅人可以足不出戶，通過計算機設備，將貨運發票上的主要信息轉換為電子信息，在一定的安全機制下，將電子信息通過互聯網傳輸給國稅機關，經國稅機關內部的貨運發票稅控收款機管理系統自動認證，產生反饋結果，并將認證結果回傳給納稅人的一種認證。
　　網上認證適用于增值稅一般納稅人。網上認證的推行以納稅人自愿為原則，即納稅人可以選用網上認證，也可以直接到主管國稅機關辦稅大廳前臺認證。已推行增值稅專用發票抵扣聯網上認證方式的企業可自動升級轉換進行貨運發票網上認證。
　　云南鹽化股份有限公司、中石化云南公司是貨運發票抵扣聯單月認證數量較多的企業，經兩戶企業進行貨運發票抵扣聯網上認證成功測試后，從7月起開始在直屬、五華、經濟局選取20戶企業進行第一階段試點工作，8月起在全市推行。