入汛后，三峽入庫流量加大，６月１８日２０時已達２１８００ｍ３／ｓ。為確保汛期大流量及奧運期間水上航行安全，應對２５０００ｍ３／ｓ的大流量警備標準，三峽通航管理局進一步完善了兩壩間限制性流量規定，以公告形式通過因特網、ＧＰＳ、紙質文件等通知到各船方，對不同的船型、主機功率按不同流量級別限制通過。 
        此前，該局完善制定了《２００８年三峽－葛洲壩兩壩間水域大流量下船舶限制性通航暫行規定》，分別對兩壩間２５０００ｍ３／ｓ、３５０００ｍ３／ｓ、４００００ｍ３／ｓ、４５０００ｍ３／ｓ等不同流量級別下船舶通航作出了具體要求，分別界定了船隊、單船限制性通航流量標準。據悉，三峽船閘停航標準今年仍為４５０００ｍ３／ｓ時，葛洲壩船閘６００００ｍ３／ｓ。４５０００到６００００ｍ３／ｓ時，僅安排進出黃柏河作業的過葛洲壩的船舶。
        ６月１９日，三峽入庫流量１８８００ｍ３／ｓ，較１８日庫區來水減少２５００ｍ３／ｓ。針對近期長江上游集中暴雨，三峽庫區支流、溪口大量樹枝、雜草、白色泡沫等漂浮物短時間涌入庫區主航道，給船舶正常航行帶來一定影響，宜昌海事局啟動防汛保暢通預案，提醒航行庫區船舶應加強了望，及時避開漂浮物，不要過于靠岸行駛，一旦發生事故時立即向就近海事機構報警。