發展金融物流業務雖然能給金融物流提供商、供應鏈節點企業和金融機構帶來″共贏″效果，但提供商卻面對各種各樣的風險。有效地分析和控制這些風險是金融物流能否成功的關鍵之一。金融物流提供商主要的風險可以歸納如下：
　�。�1）內部管理風險：這也是企業中普遍存在的風險之一。包括組織機構陳舊松散，管理體制和監督機制不健全，工作人員素質不高，管理層決策發生錯誤等等。在中國，企業內部管理風險往往較大。
　�。�2）運營風險：物流企業都會面臨運營方面的風險。但從事金融業務的物流公司，由于要深入客戶產銷供應鏈中提供多元化的服務，相對地擴大了運營范圍，也就增加了風險。從倉儲、運輸、到與銀企之間的往來以及和客戶供銷商的接觸，運營風險無處不在。中國的物流運輸業還處在粗放型的發展階段，因此運營風險不容忽視。
　�。�3）技術風險：金融物流提供商因缺乏足夠的技術支持而引起的風險。比如價值評估系統不完善或評估技術不高，網絡信息技術的落后造成信息不完整、業務不暢等。
　�。�4）市場風險：主要針對庫存質物的保值能力。包括質物市場價格的波動，金融匯率造成的變現能力改變等。
　�。�5）安全風險：質物在庫期間金融物流提供商必須對其發生的各種損失負責，因此倉庫的安全，員工的誠信，以及提單的可信度都要加以考慮。還包括對質物保存的設施能否有效防止損壞、變質等問題。
　�。�6）環境風險：指政策制度和經濟環境的改變。包括相關政策的適用性，新政策的出臺，國內外經濟的穩定性等。一般情況下，中國的政治和經濟環境對金融物流造成的風險不大。但國際環境的變化，會通過貿易、匯率等方面產生作用。
　�。�7）法律風險：主要是合同的條款規定和對質物的所有權問題。因為業務涉及多方主體，質物的所有權在各主體間進行流動，很可能產生所有權糾紛。另一方面，中國的《擔保法》和《合同法》中與金融物流相關的條款并不完善，又沒有其他指導性文件可以依據，因此業務合同出現法律問題的機率也不低。
　�。�8）信用風險：包括貨物的合法性，客戶的誠信度等，同時信用風險還與上述財務風險、運營風險、安全風險和法律風險等聯系密切。在具體實施金融物流業務時，應該結合上述的主要風險問題進行相應的風險管理。