數據顯示，截至2006年末，農發行各項貸款余額8844億元，凈增額同比多增40%。全年累計投放糧棉收購貸款2507億元，同比增長25%，支持收購糧食3139億斤、棉花7746萬擔。在糧食連年豐收、棉花市場復雜的情況下，支持收購沒有出現問題。同時，累計投放農業產業化龍頭企業和加工企業貸款825億元，同比增長2.5倍；發放農業小企業貸款近10億元。
數據表明，市場化發債已成為農發行構建多元化籌融資機制的重要內容之一，2006年該行共發行17期金融債券，籌集資金2000億元。另外，農發行已獲準在全國范圍內開辦非結算用途的金融機構同業存款業務，2006年該行各類存款余額達1915億元，同比增長52%。其資金自籌率提高了20.7個百分點，對擴大其資金來源、降低資金成本具有重要意義。
引人關注的是，2006年末，農發行不良貸款余額比上年下降了133億元，不良貸款率為7.65%，比年初下降2.65個百分點。全年實現經營利潤87.7億元，同比增長62%，其中賬面利潤14.66億元，核銷呆賬73.04億元。至年末農發行資本充足率為6.27%，剔除政策性業務因素，商業性業務資本充足率達12.19%。
