然而，部分現(xiàn)行政策制度滯后于加工貿(mào)易發(fā)展實踐，加工貿(mào)易轉(zhuǎn)型升級對現(xiàn)行制度提出了五項需求，亟待引起有關(guān)部門的重視：
放寬加工貿(mào)易范圍。監(jiān)管部門對加工貿(mào)易的管理集中于對企業(yè)生產(chǎn)制造環(huán)節(jié)的關(guān)注，把有形物質(zhì)監(jiān)管、實質(zhì)性加工、企業(yè)生產(chǎn)能力、出口成品與進口料件的數(shù)量對應(yīng)關(guān)系作為開展加工貿(mào)易必不可少的關(guān)鍵條件，直接導(dǎo)致我國無法將技術(shù)含量高、增值收益大的研發(fā)設(shè)計、營銷以及后續(xù)服務(wù)等環(huán)節(jié)納入加工貿(mào)易業(yè)務(wù)范圍，已嚴重不適應(yīng)當前產(chǎn)業(yè)鏈環(huán)節(jié)外包化的加工貿(mào)易發(fā)展趨勢，制約了加工貿(mào)易產(chǎn)業(yè)鏈的延伸，影響了加工貿(mào)易的轉(zhuǎn)型升級。例如，目前在我國東南沿海地區(qū)已成領(lǐng)軍之勢的 IT、IC產(chǎn)業(yè)，其產(chǎn)業(yè)鏈上游的集成電路設(shè)計和軟件開發(fā)產(chǎn)業(yè)、下游的維修檢測等業(yè)務(wù)需求旺盛，但現(xiàn)有限制性規(guī)定卻斷裂了上下游企業(yè)之間的關(guān)鍵鏈接，加工貿(mào)易也被壓縮在狹窄的低收益空間。
拓展保稅區(qū)域功能。目前我國出現(xiàn)保稅區(qū)、出口加工區(qū)、保稅港區(qū)、保稅物流中心、保稅物流園區(qū)等多種特殊監(jiān)管區(qū)域(場所)，均是應(yīng)加工貿(mào)易生產(chǎn)、商務(wù)、物流等方面的需要而設(shè)立的，但所有功能區(qū)域(場所)之間都是割裂的，市場主體不可能在一個區(qū)域(場所)中獲得所需的整套服務(wù)，導(dǎo)致加工貿(mào)易生產(chǎn)加工與物流服務(wù)相脫節(jié)，研發(fā)、制造、營銷環(huán)節(jié)相阻隔，同時造成企業(yè)操作手續(xù)繁瑣、監(jiān)管部門壓力較大、社會資源浪費嚴重等一些負面現(xiàn)象。
明確準入退出標準。制定產(chǎn)業(yè)指導(dǎo)目錄，建立加工貿(mào)易準入退出機制，是引導(dǎo)轉(zhuǎn)型升級的重要手段。我國現(xiàn)行政策并未對加工貿(mào)易的技術(shù)水平進行甄別，而是將簡單工藝加工貿(mào)易和高附加值、高科技產(chǎn)品加工貿(mào)易不加區(qū)別地給予優(yōu)惠，沒有很好地體現(xiàn)國家的產(chǎn)業(yè)政策精神，不利于我國的加工貿(mào)易向延伸產(chǎn)業(yè)鏈、提高增值率和技術(shù)含量的方向發(fā)展。而有時因為一些政策目標，又簡單采取"一刀切"的辦法予以限制。但在同一產(chǎn)業(yè)內(nèi)部，不同企業(yè)之間的生產(chǎn)環(huán)節(jié)、工藝技術(shù)、成品科技含量往往存在較大差異，對資源消耗、環(huán)境污染、貿(mào)易摩擦等指標有著不同的影響。江蘇蘇州地區(qū)某紙業(yè)集團從國外進口紙漿，出口成品紙張，耗能高、污染重、消耗森林資源多的制漿工序已在國外完成，對境內(nèi)的資源、能源、環(huán)境壓力并不大，產(chǎn)品增值率也比較高。但因造紙行業(yè)屬于高能耗、高污染產(chǎn)業(yè)，自2006年1月1日起已不被允許從事加工貿(mào)易業(yè)務(wù)，結(jié)果技術(shù)先進的企業(yè)也被連坐而"一網(wǎng)打盡"。
便利監(jiān)管模式。在目前的監(jiān)管模式中，商務(wù)、海關(guān)、國稅、外匯管理等部門各自為政，分線管理，各個部門往往從本部門管理方便的角度出發(fā)，較多關(guān)注如何防止不法企業(yè)利用加工貿(mào)易政策"走私"、"騙退稅"，對于如何鼓勵加工貿(mào)易提高產(chǎn)業(yè)層次和加工深度，增強國內(nèi)配套能力，促進國內(nèi)產(chǎn)業(yè)升級，從而提高其對國民經(jīng)濟貢獻這個根本的政策目標，卻考慮得較少，對加工貿(mào)易轉(zhuǎn)型升級的整體需求難以迅速有效地形成綜合性的公共政策回應(yīng)，導(dǎo)致行政效率損失。同時，該監(jiān)管模式側(cè)重于審批，如企業(yè)僅在海關(guān)就要辦理備案、核銷、補證、補稅等諸多審批手續(xù)，再如深加工結(jié)轉(zhuǎn)或外發(fā)加工還需逐票審批，繁冗的行政審批已不符合加工貿(mào)易轉(zhuǎn)型升級對物流時效和成本控制的要求。
完善稅收機制。就稅收激勵機制而言，缺乏從加工貿(mào)易轉(zhuǎn)型升級角度考慮的技術(shù)性安排，如對研發(fā)中心的具體運作就缺乏實質(zhì)性的激勵措施。目前的國家出口退稅制度存在對國產(chǎn)物料的征退稅差(征17%，退13%)，打擊了加工貿(mào)易企業(yè)加大國內(nèi)采購力度的積極性。就稅收保全機制而言，原有的加工貿(mào)易保證金臺帳制度側(cè)重于對企業(yè)的海關(guān)信譽的引導(dǎo)，缺乏對加工貿(mào)易轉(zhuǎn)型升級的政策引領(lǐng)功能。就部門間政策配套而言，目前海關(guān)對出口到加工區(qū)、保稅區(qū)和保稅物流中心的加工貿(mào)易貨物都視同實際出口予以核銷，但稅務(wù)部門只認同出口加工區(qū)和保稅物流中心予以退稅，阻礙了加工貿(mào)易產(chǎn)業(yè)鏈向倉儲、運輸?shù)葒鴥?nèi)相關(guān)產(chǎn)業(yè)環(huán)節(jié)的延伸，抑制了增值率的提升；而對于深加工結(jié)轉(zhuǎn)業(yè)務(wù)，海關(guān)手冊核銷時視同實際出口，但稅務(wù)部門則必須實際出口才予退稅，客觀上導(dǎo)致企業(yè)采取"香港一日游"等方式，犧牲物流成本換取出口退稅，增值收益被無端空耗。
