2006年，成立了平湖、筍崗—清水河、前海灣三大物流園區領導小組和園區辦，理順了物流園區的管理體制，六大物流園區建設運營全面提速。正式出臺了《現代物流業發展專項資金管理暫行辦法》和《重點物流企業認定管理暫行辦法》，對11家重點物流企業貸款貼息900多萬元，評估認定一批重點物流企業和項目，發放獎勵資金450萬元；發布了《深圳市重點物流企業創新服務條例》，首次設立了“重點物流企業服務創新獎”，對2家獲獎企業給與100萬元獎勵；現代物流業占全市GDP的9.2%，產業積聚效應凸顯。
    一年來，全行業共有13個單位，22名個人受到國家、省、市表彰：我局被評為全國港建費征管先進單位、廣東省2007年春運工作先進單位、全省交通系統科技教育先進集體、市重大項目建設工作先進單位、清理整治無證無照非法經營工作優秀單位，運政監督分局被評為全國交通行業文明示范窗口，港口質監站被評為“十五”期全省交通工作先進集體，市公路局養護監管處被評為全省交通系統抗洪搶險救災復產先進集體，羅湖汽車站被評為“十五”期全省交通工作先進集體，金鷹出租汽車公司被評為深圳市先進企業，行業風氣、行業面貌和行業形象得到大幅提升。
    2007年是深入貫徹落實科學發展觀、積極推進社會主義和諧社會建設的重要一年。做好今年的交通工作，保持交通事業發展的良好勢頭，對于逐步實現交通“十一五”規劃目標，保障全市社會經濟持續和諧發展，意義十分重大。