方案要求，建立健全信息共享共用機制。建立信息全面交換和數據使用管理辦法。依托電子口岸平臺，以共享共用為原則，推動口岸管理相關部門各作業系統的橫向互聯，實現口岸管理相關部門對進出境運輸工具、貨物、物品(如外幣現鈔)、人員等申報信息、物流監控信息、查驗信息、放行信息、企業資信信息等全面共享。對有保密要求的信息實行有條件共享。
方案提出，推動一體化通關管理。強化跨部門、跨地區通關協作，加快推進內陸沿海沿邊一體化通關管理，實現在貨物進出口岸或申報人所在地海關和檢驗檢疫機構均可以辦理全部報關報檢手續。除特定商品管理需求外，逐步取消許可證件指定報關口岸的管理方式，實現申報人自主選擇通關口岸。
方案明確，建立口岸安全聯合防控機制。加大口岸安防設施設備等硬件的投入。完善口岸監管執法互助機制，強化口岸管理相關部門在防控暴恐、應對突發事件、打擊走私、打擊騙退稅、查處逃避檢驗檢疫、反偷渡和制止不安全產品及假冒偽劣商品進出境等方面的全方位合作。
