福建地處中國大陸東南沿海，與臺灣省一水之隔，北接長三角，南聯珠三角，扼東海與南海之交通要沖，具有優越的海洋區位條件，發揮著承南啟北、貫通東西的橋梁紐帶作用。隨著福建海洋經濟發展，兩岸通航船舶密度日益增大，加之南北過往船舶數量增加，又受臺灣海峽“狹管效應”的影響，福建沿海水域歷年來都是我國沿海水上交通事故的高發區。2014年，交通運輸部將臺灣海峽列為“六區一線”，成為水上交通重點監管區域。
面對復雜的水上交通安全形勢，福建海事局努力推進綜合性的海事監管事項研究，著力改善福建沿海的通航環境，全面規劃福建沿海的航路、航道、錨地，加大對臺灣海峽大陸一側水域的通航環境秩序的規范化管理。同時加大對海上交通安全風險的探索研究，在基于船舶交通流和事故規律性研究的基礎上，福建海事局組織編寫了《福建沿海航行指南》（以下簡稱《指南》），供廣大航海者熟悉、了解、掌握福建沿海通航環境特點，進而采取針對性措施，避免水上交通事故發生。
《指南》較為詳細介紹了福建沿海南北航路、兩岸直航航路、海區及港區通航環境、船舶進出港航法、船舶交通流特點、主要航行風險、注意事項及港口服務等內容，收錄了部分與船舶航行密切相關的海事管理規定和規章制度。《指南》由正文和相關附件組成。正文約31萬字，內有插圖260幅、表格65張。附件主要包括碼頭泊位一覽表、VTS指南等5個附件。
