奎屯保稅物流中心于2013年8月8日，由國家海關總署、財政部、稅務總局、外匯管理局批準設立，是新疆唯一一家B型保稅物流中心。該中心由新疆西部明珠保稅物流有限公司投資3.5億元建設，占地面積1009畝，其中海關特殊監管區509畝，包括封閉式保稅倉庫1.2萬平方米、堆場27萬平方米等。目前，海關查驗庫、視屏監控系統、庫區進出口查驗卡口、電子識別系統、封閉網圍欄、報關大廳等項目已建設完成。
伊犁州黨委常委、奎屯市委書記趙永龍表示，奎屯保稅物流中心的封關運營標志著奎屯市的對外開放步入了一個新的階段，奎屯市將以此為契機，擴大對外開放，提升對外經濟發展形象，建設區域商貿物流中心、進出口加工基地，使奎屯市發展成為絲綢之路經濟帶上的重要支點。
新疆農資（集團）有限責任公司副總經理、新疆西部明珠保稅物流有限公司董事長余戰海說，奎屯保稅物流中心通過國家驗收封關運營后，將緊緊抓住新疆建設絲綢之路經濟帶核心區的重大機遇，利用境內關外、出口退稅、交易免稅、進口保稅、外匯優惠、保稅金融、轉口貿易等特殊功能和政策，通過為入駐企業提供進出口商品一次申報、一次查驗、一次放行的服務，減少企業運營成本、節約貨物運輸時間、加快企業資金流轉，并通過與霍爾果斯、阿拉山口口岸外運企業的合作，利用區位優勢大力發展國際聯運，成為口岸貨物轉關、疏港承接地，建設具有“港口內設、就地辦單、鐵路聯運、無縫對接”的國際內陸港。
