12日，記者從廣鐵獲悉，當天14時57分，廣深港高鐵廣州南至深圳北動車組列車已恢復運行。截至記者發稿時，廣鐵管內受水害影響的線路已全部恢復行車。
　　據廣鐵早前消息，12日凌晨，鐵路部門組織對廣深港高鐵沿線巡查維護中發現，深圳北至光明城區段有一處山坡發生泥石流。為確保運輸安全，鐵路部門決定封鎖水害區段，連夜組織工程技術人員趕赴現場搶修處置，并停運12日12時前的廣州南至深圳北動車組列車。直至14時57分，廣州南至深圳北動車組列車才恢復運行。
　　受此影響，廣深港、武廣高鐵、廈深鐵路共有多趟旅客列車須停運或改變始發車站。
　　此外，受特大暴雨影響而臨時封鎖的廣深線Ⅰ、Ⅱ線（動車組線路）以及廣深線Ⅲ、Ⅳ線（普速列車線路），已分別于11日21時43分、12日6時解除封鎖。不過，水害地段列車限速60公里/小時運行，途經廣深普速鐵路的各次長途列車仍有不同程度晚點。