2009年福建交通集團受到國際金融危機的嚴重沖擊，物流、港口、航運等主業(yè)經(jīng)營十分困難，對此，新組建的福建交通集團領導班子迎難而上，緊緊抓住國務院出臺的物流業(yè)調(diào)整和振興規(guī)劃以及支持福建省加快建設海峽西岸經(jīng)濟區(qū)的若干意見的重大戰(zhàn)略機遇，團結(jié)帶領全體干部職工，開源節(jié)流，降本增效。 
　　一年來集團整合重組工作有序推進，港口建設穩(wěn)步開展，海運運力規(guī)模迭創(chuàng)新高，物流拓展有效提升，商貿(mào)購銷有所創(chuàng)新，場站布局得到完善，對臺合作再次突破，黨的建設和精神文明建設持續(xù)深化。企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營逐步穩(wěn)定，企業(yè)經(jīng)濟效益逐步回升，安全生產(chǎn)安定穩(wěn)定，較好地完成了全年各項預算指標。2009年企業(yè)在經(jīng)營狀況不理想的情況下，仍然實現(xiàn)營收50.99億元,首次突破50億元大關(guān)。