蓄水之后，長江三峽最直接、最大的變化莫過于航道條件發生了轉變：長江水變緩了、變深了、變寬了。水變商機現。"23日，長江萬州段的水位已蓄至153.2米，并且江面將隨著水位上升逐漸增寬。"23日，萬州區航道部門的負責人告訴記者，從此長江行船油耗將減少，載重噸位將增加，萬噸級船隊將可以直接停靠重慶港，長江航運將擁有無可比擬的價格優勢。 　　有關資料表明：三峽工程建成后，水庫回水到重慶，形成深水航道，平均水深為70米，最大水深達170米，水庫平均寬度約1100米，比建庫前航道寬度拓展約1倍，回水區流速減少50％。船舶每馬力拖載量因此增加至7－10噸，是原來的10倍；外運貨物單向通過能力增加至5000萬噸，是原來的5倍；船舶運行周期將縮短一半左右。
　　據測算，蓄水后長江航運的成本將從目前每噸公里0．03－0．04元的基礎上降低36％左右，遠遠低于陸路運輸每噸公里0．5元左右的成本。
　　目前，一些航運企業對這條"黃金水道"已是虎視眈眈。由于萬州將成為西部地區一個重要的出海口，目前三峽庫區各大輪船公司紛紛更新設備。一些大型航運企業也正在新造集裝箱船。看到長江未來航運形勢的分析報告，國內外一些大型公司將最終選擇通過長江運送貨物進出西部。四川一些大型企業也有意開始大批量改走長江水運到上海出境。