自國際金融危機爆發以來，汕頭保稅區海關針對汕頭保稅區的發展需要，出臺了一系列促進發展的措施，以實際舉措改善汕頭保稅區的投資軟環境，提高企業在國際市場的競爭力。 
一是專門整合設立了“保稅區業務監管科”，為保稅區企業通關提供“一條龍”服務。與此同時，進一步規范進出保稅區卡口管理，簡化了驗放手續，對進出保稅區的貨物按照海關監管貨物和非監管貨物、倉儲貨物和生產料件以及企業基建材料等類別，實施分類管理，為保稅區企業提供靈活的通關便利。 
二是及時對保稅倉儲業務實施了“備報合一”、“查銷合一”的便利措施，為企業提供了“非國家禁止進口商品，保稅倉儲無須提前申請”的便利，增強了企業經營的靈活度。同時啟動“區港互動”措施，建立保稅區與廣澳深水港碼頭的直通式快速通道，大力支持企業開展保稅倉儲業務。
三是密切關注企業的發展態勢，積極回應企業的要求，堅持特事特辦幫助信譽良好企業解決困難。