在新的“三定”規(guī)定起草擬訂過程中，交通運輸部對近年來制約交通運輸業(yè)發(fā)展的體制機制等問題進行了梳理，對促進綜合運輸體系建設、理順外部職責關系以及內設機構和編制等長期存在的突出問題進行了認真研究。雖然改革的最終成效仍需后續(xù)細化職責并落實，但就規(guī)定本身而言，在解決上述問題方面均取得了較大進展。 
　　處處體現(xiàn)一個“綜”字“將原交通部職責、原中國民用航空總局制定民航行業(yè)規(guī)劃、政策和標準職責，原建設部指導城市客運職責整合劃入�！� 
　　“加強綜合運輸體系規(guī)劃協(xié)調工作，優(yōu)化交通運輸布局調整和交通運輸方式的相互銜接，加快形成便捷、通暢、高效、安全的綜合運輸體系�！� 
　　“加強統(tǒng)籌區(qū)域和城鄉(xiāng)交通運輸?shù)陌l(fā)展，優(yōu)先發(fā)展公共交通，大力發(fā)展農村交通，加快促進區(qū)域和城鄉(xiāng)交通運輸一體化。” “積極探索和完善職能有機統(tǒng)一的交通運輸大部門體制建設，進一步優(yōu)化組織結構，完善綜合運輸行政運行機制�！� 
　　以上都是“三定”規(guī)定的職責調整中關于構建綜合運輸體系的論述。顯然，規(guī)定對綜合運輸以及協(xié)調區(qū)域交通發(fā)展的要求明顯加強。發(fā)展綜合運輸體系，符合我國交通運輸發(fā)展實際和世界交通運輸發(fā)展規(guī)律和趨勢，符合科學發(fā)展觀的根本要求，符合實現(xiàn)全面建設小康社會奮斗目標的新要求，符合優(yōu)化總體布局、發(fā)揮組合效率的內在要求。 
　　組建交通運輸部，將公路、水路、民航融為一體，對優(yōu)化交通運輸布局，加快形成便捷、通暢、高效、安全的綜合運輸體系將有著極大的促進作用。交通運輸部“三定”規(guī)定，在探索“大部門體制”中邁出了堅實的步伐。 
　　按照交通運輸部“三定”規(guī)定實施機構改革，將使交通運輸工作站在一個新的起點上，但這也同時給交通運輸管理部門帶來了新的挑戰(zhàn)。畢竟，要從已經熟悉的傳統(tǒng)的公路水路發(fā)展模式中跳出來，站在發(fā)展綜合運輸體系的高度，謀劃和推進交通運輸?shù)目茖W發(fā)展，不是一件簡單的事。 
　　三方面理清交叉職能 
　　“承擔涉及綜合運輸體系的規(guī)劃協(xié)調工作，會同有關部門編制綜合運輸體系規(guī)劃，指導交通運輸樞紐規(guī)劃和管理�！� “組織擬定并監(jiān)督實施公路、水路、民航等行業(yè)規(guī)劃、政策和標準，組織起草法律法規(guī)草案，制訂部門規(guī)章，參與擬定物流業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略和規(guī)劃，擬定有關政策和標準并監(jiān)督實施，指導公路、水路行業(yè)有關體制改革工作�！� 
　　“由交通運輸部牽頭，會同國家發(fā)展和改革委員會，建立綜合運輸協(xié)調配合機制。交通運輸部會同有關部門，組織編制綜合運輸體系規(guī)劃，承擔涉及綜合運輸體系規(guī)劃有關重大問題的協(xié)調工作。國家發(fā)展和改革委員會負責綜合運輸規(guī)劃與國民經濟和社會發(fā)展規(guī)劃的銜接�！� 
　　“城市地鐵、軌道交通方面的職責中，交通運輸部指導城市地鐵、軌道交通運營，市政部門指導城市地鐵和軌道交通的規(guī)劃和建設，兩部門要加強協(xié)調配合，做好城市地鐵、軌道交通規(guī)劃與城市公共交通整體規(guī)劃的有效銜接�！� 部委之間理清交叉職能，權責找“公約數(shù)”，是“三定”規(guī)定的一大亮點。理清部委之間的交叉職能，合理分工，更能體現(xiàn)出服務的水平，也便于管理。 
　　交通部與其他部委之間的職能交叉現(xiàn)象存在已久。比如，車輛超限超載運輸治理，需要7個部委共同協(xié)作才能完成，正如公眾所批評的：不同的監(jiān)管部門“各吹各的號，各唱各的調”，導致“7個部門管不好一輛車！”就現(xiàn)狀而言，我國交通運輸實行的是各種運輸方式分屬不同部門管理，而在同一種運輸方式中，運輸?shù)墓芾砺毮芤蔡幱诜稚⒐芾頎顟B(tài)，條塊分割問題突出。 
　　再以交通規(guī)劃為例，名義上地位很高，但權威性和可實施性實際相當差。從中央到地方省市，交通規(guī)劃主管部門有時是交通部門，有時則是地方發(fā)改委或規(guī)劃局，還有時甚至是省長或市長親自掛帥制定，經常需要發(fā)改委出面協(xié)調。結果是有太多的部門想“負責規(guī)劃”，卻無法確定哪個部門及行政首長應“對規(guī)劃負責”。 
　　一些例子聽起來頗為極端:比如交通部負責路政管理，公安部負責道路安全管理，兩部門為此屢有不同意見。如成渝高速公路，交通部認為這是管得非常好的一條線，公安部認為是死亡之路，差別就這么大。再比如，一輛出租車，在城市運行歸建設部管轄，一旦出城行駛在公路上就歸交通部管理。 
　　針對這些問題，這次“三定”中也提出了解決辦法：一是解決了一些長期存在的職責交叉問題。二是對確需多個部門管理的事項明確了牽頭部門。三是建立健全了部門間的協(xié)調配合機制，形成工作合力。 
　　政府權力下放 
　　“取消已由國務院公布取消的行政審批制度�！� “將組織推廣公路、水路機械設備技術、協(xié)調機械設備調劑等職能交給事業(yè)單位，將港口企業(yè)與國際港口組織聯(lián)絡等工作交給有關行業(yè)協(xié)會�！� 
　　“權力下放”是交通運輸部“三定”規(guī)定的亮點之一，這也是國務院職能部門減少微觀作業(yè)的具體體現(xiàn)。目前的“三定”規(guī)定，明確取消了一些微觀管理、行政審批等事項，將可以由地方承擔的事務交給地方政府，將一些技術性和具體事務交給事業(yè)單位或中介組織。 
　　國家行政學院公共行政教研室主任竹立家教授表示，不論是在國外還是在中國，作為國家的政府組成部門，主要是進行政策的制定，市場的監(jiān)管。取消具體的微觀作業(yè)，可以切斷腐敗的來源，比如，“政府推介某項技術或設備，難免會出現(xiàn)一些腐敗行為，比如一些企業(yè)通過商業(yè)賄賂向政府官員行賄、受賄�！敝窳⒓艺f。 
　　強調責任而不是權力 
　　“承擔道路、水路運輸市場監(jiān)管責任。組織制定道路、水路運輸有關政策、準入制度、技術標準和運營規(guī)范并協(xié)助實施，指導城鄉(xiāng)客運及有關設施規(guī)劃和管理工作，指導出租汽車行業(yè)管理工作，負責汽車出入境運輸、國際客貨運輸及航道有關管理工作�！� “承擔公路、水路建設市場監(jiān)管責任。制定公路、水路建設相關政策準入和技術標準并監(jiān)督實施，組織協(xié)調公路、水路有關重點工程建設和工程質量、安全生產監(jiān)督管理工作，指導交通運輸基礎設施維護，承擔有關重要設施的運營維護，按規(guī)定負責港口規(guī)劃和安全監(jiān)管工作�！� 
　　關于交通運輸部要“承擔”的“責任”，“三定”規(guī)定中都有明確的表述。權力與責任相統(tǒng)一是行政管理的基本要求。但長期以來，政府運行中一直存在著一些權責脫節(jié)、重權輕責、缺乏監(jiān)督，有利的事情爭著管、出了問題沒人負責的現(xiàn)象，這背后的一個深層次原因就是相關部門的責任不明確，沒有真正把責任落實到位。新的機構改革方案，要求進一步明確部門責任，確保權責一致，提高政府執(zhí)行力和公信力。 
　　按照這一要求，這次“三定”在落實交通運輸部的部門職能時，尤其注重明確和強化部門責任。這不但有利于增強政府部門及其工作人員的責任意識和服務意識，提高政府的執(zhí)行力和公信力，同時也為推行行政問責制、加強責任追究提供了必要的依據(jù)。 
　　人員編制不增加 
　　“交通運輸部機關行政編制398名，設部長1名，副部長4名，司局級領導職數(shù)56名�？偣こ處�2名，安全總監(jiān)1名，總規(guī)劃師1名。機關黨委領導職數(shù)1名，離退休干部局領導職數(shù)1名�！备鶕�(jù)此次“三定”規(guī)定，交通運輸部沒有增加行政編制。 
　　中央機構編制委員會辦公室副主任黃文平介紹說，這次改革雖然沒有確定具體的精簡指標，但編辦還是按照中央關于嚴格控制機構編制的各項規(guī)定， 
　　對新組建或調整變動的部門，按照“人隨事走”的原則，人員編制先隨職責劃轉，計入新部門基數(shù)后重新核定，有減有增。其他部門的人員編制均沒有增加，國務院行政編制總量沒有突破。 
　　在領導職數(shù)方面，核定部門正職1名、副職不超過4名。不再擴大部長助理和秘書長的設置范圍，經批準已經設置的，職數(shù)不再增加。司局級領導職數(shù)按規(guī)定的每司1正2副核定，增設內設機構的、司局加掛牌子的、承擔議事協(xié)調機構日常工作的或部分重點業(yè)務司局任務比較重的，相應核增了司局級領導職數(shù)�？偣こ處�、總規(guī)劃師等專業(yè)技術性領導職務嚴格限定在專業(yè)性、技術性較強的部門。 
　　黃文平解釋，目前領導超過5名的部門，大多是由于機構整合后，在人員安排方面客觀上需要一個過渡時期，今后將通過部門領導班子的新老更替、干部調配等方式逐步消化。還有少數(shù)部門是由于職責面較寬，中央從加強其領導班子建設的角度出發(fā)批準超配的，對此，也將根據(jù)實際情況統(tǒng)籌考慮加以解決。 
　　旨在實現(xiàn)平穩(wěn)過渡 
　　在內設機構設置中，雖然“公路局”、“水運局”仍屬部機關內設局級機構，更名后職能變化也不大，但這是為下一步成立國家公路局、國家水運局做準備。 
　　作為一個跨行業(yè)的綜合系統(tǒng)，交通運輸業(yè)的系統(tǒng)效率，不僅取決于各種運輸方式各自的技術裝備和管理水平，也取決于系統(tǒng)整體的內部協(xié)調與整合水平。從國際經驗看，要提高交通運輸系統(tǒng)整體的內部協(xié)調和整合水平，需要建立對各種運輸方式實行綜合統(tǒng)一管理的交通管理體系，并在此基礎上對交通運輸業(yè)的長遠發(fā)展進行科學的整體規(guī)劃。此次的大交通改革，顯然不再只是部門之間簡單的合并重組，而是對于交通部門同類管理職能的合并和重新梳理。然而，交通系統(tǒng)內部的管理職能的合并和梳理，不像想象中的那么容易。目前的實際情況是，由于各種運輸方式的市場化進展不一，管理體制差異很大，因此整合難度也很大。 
　　機構改革涉及職能調整、機構整合、人員定崗、機制完善等，工作頭緒多、任務重。如果在目前狀況下，倉促地實行交通運輸部門的改革合并，必當引起極大的體制震蕩。因此，在中國推行“大部制”的迫切性雖強，但也不能一蹴而就。過渡方案的處理，符合我國改革發(fā)展的實際情況。 
　　同時，按照方案，這次國務院機構改革并不是單兵突進，還統(tǒng)籌考慮了事業(yè)單位的改革，對推進事業(yè)單位分類改革提出了明確要求，還要求更好地發(fā)揮社會組織在社會公共事務管理中的作用。這些將為我國深化行政管理體制和機構改革營造良好的社會環(huán)境和條件。