隨著廣州南沙港區的迅猛發展，廣州海關積極推動南沙的輻射效應，以期為當地經濟發展注入動力。 
　　廣州港口岸南沙港區位于珠江三角洲地理幾何中心，海上距香港38海里，距澳門41海里，方圓100公里內覆蓋整個珠三角城市群，地理位置優越，具有很強的市場潛力和輻射力，是連接珠三角兩岸城市群及港澳地區的樞紐性節點。自2004年9月南沙港區臨時對外開放以來，南沙港區建設發展迅猛。 
　　廣州市南沙區既是廣州市新的行政區域，也是新的臨海工業經濟區。按照廣州市政府的規劃，南沙區將以發展現代化大港口為中心，突出發展臨港大工業、高新技術產業和國際物流產業，構建重工化工業、高技術產業和現代物流業三大產業組團。 
　　南沙港區正式對外開放后，廣州海關以落實《珠江三角洲地區改革發展規劃綱要》為契機，推進區內電子預歸類、電子預審價等快速通關，將平均報關單作業時間縮短至1.37小時；推廣“海運出口艙單互認”、“一關通”等監管模式，促進以南沙港為龍頭的廣州港區發展成為華南地區的航運中心、物流中心，支持南沙港區、園區和產業區的建設，配合地方政府申報南沙保稅港區并獲得國務院的批準，積極推動南沙成為開放層次最高、政策最優惠、功能最齊全、優勢最明顯、發展最全面的區域。