3月25日，南沙海關正式掛牌開關。當日上午11時許，在位于廣州市南沙區南沙街進港大道聯檢中心的海關大樓前，舉行了簡樸、莊重的揭牌儀式，廣東省副省長萬慶良、廣州市副市長陳明德、海關總署廣東分署副主任何力、廣州海關關長郗治安一起為南沙海關牌匾揭幕。隸屬于廣州海關的南沙海關即日起正式對外辦理海關業務。

　　據介紹，2007年12月國務院在批復廣州港南沙港區口岸開放的同時，同意設立處級南沙海關。2008年4月，海關總署批復同意設立南沙海關，并明確了南沙海關業務管轄范圍為廣州市南沙區。2009年3月，海關總署批復同意南沙海關自2009年3月25日起開辦業務。

　　南沙海關隸屬廣州海關，是通關現場型和轄區管理型相結合的隸屬海關，業務管轄范圍為廣州市南沙區，地處珠江三角洲的中心腹地，位于粵、港、澳黃金經濟圈的核心部位，是珠江西岸經濟發展最活躍的地區之一。

　　南沙海關轄區范圍內海關監管點多面廣，從來往港澳小型船舶碼頭到大型國際集裝箱碼頭，從貨柜車檢查場到旅檢客運口岸，從保稅倉到保稅港區等海關業務門類和海關特殊監管區域一應俱全，是廣州海關業務改革和創新先行之地，也是廣州海關業務發展的重點區域。

　　南沙區范圍內的海關業務原由番禺海關負責管轄，隨著2004年廣州港南沙港區的建成投產，以及2005年廣州市新設立南沙區的行政區域后，南沙區內的外向型經濟迅猛發展，海關監管業務量也日益攀升。據統計，南沙區內海關監管的貨物總值從2006年55.9億美元上升至2008年的109.1億美元；海關監管貨運量從2006年的604萬噸上升至2008年1025萬噸，海關征收稅收入庫從2006年的35.4億元上升至2008年的57.7億元。良好的物流環境和便捷的地理優勢，造就了區域內海關特殊監管區域的多樣性發展。2005年國務院批準設立廣東南沙出口加工區，2008年國務院批準設立廣州南沙保稅港區，2008年12月廣州南沙國際物流出口監管倉庫享受入倉退稅政策等，均為南沙區的經濟發展帶來新的活力。隨著物流環境的進一步完善和提升，南沙區吸引了眾多的國際知名企業進駐投資，并逐步形成了汽車制造、石化儲運、船舶修造、港口物流、重型加工、高新技術、化工產品等特色產業。

　　面對如此快速的地區經濟發展，原有的“一關兩區”模式已難以滿足未來發展的要求，南沙海關的設立呼之欲出。按照廣州海關“把南沙海關建設成為專業化、自動化、信息化、智能化、規范化、制度化的新型海關”的要求，南沙海關在籌建初期就精心謀劃、科學設置海關機構，共設置17個科室，其中包括專門為石化產業和大型裝備制造業量身訂做的兩個專業化監管科室，凸顯專業化管理特色。

　　南沙海關成立后，南沙區的企業辦理企業備案、加工貿易手冊業務或減免稅業務，不必跋涉近50公里到番禺區，可以在家門口就近辦理，為企業節省成本的同時也提高了辦事效率。與此同時，海關的各項業務和內部管理也隨著南沙海關的成立更趨集約高效，對海關業務風險和執法風險的防控也將更加到位。

　　據悉，南沙海關貨運口岸現場將實行“5+2”工作日制度，推行每周7×24小時預約通關服務，為企業在南沙口岸通關提供更多的便利；支持南沙客運碼頭開通夜航班輪和節假日加班航班，加大客運碼頭的海關人力資源投入，為南沙地區的經貿往來和對外旅游的發展創造更加便利條件；支持和促進南沙保稅港區早日通過國家驗收，并提供一體化海關監管服務，以統一的海關監管模式監管港口作業區、出口加工區和保稅物流園區的業務，促進港口物流和保稅物流的無縫對接和高效流轉。