在廣西北部灣經濟區保稅物流體系建設中，南寧海關把支持北部灣經濟區設立海關特殊監管區域作為海關支持北部灣經濟區建設的重要載體，分階段、分步驟全力配合自治區政府作好北部灣經濟區海關特殊監管區域和保稅監管場所的論證申報、報批跟蹤及規劃建設等各項工作。 

    廣西欽州保稅港區和廣西憑祥綜合保稅區獲國務院批復后，南寧海關發揮海關專業指導職能，結合廣西實際，對廣西欽州保稅港區和廣西憑祥綜合保稅區的功能布局、基礎和監管設施建設、信息管理系統建設開發等工作積極提供建議。 

【南寧海關副關長 吳海平： 在下一步的工作中，我們南寧海關主要是全力以赴地支持促進，來幫助地方政府怎么樣把批下來的這些特殊監管區域和保稅監管場所把它建設好，確保有關的特殊監管區域和監管場所建起來之后能夠順利地通過國家驗收。】 

    與此同時，廣西出入境檢驗檢疫局也結合自身實際，為適應北部灣經濟區開放開發需要及時制定了服務北部灣經濟區建設工作方案，積極參與制定欽州保稅港區和廣西憑祥綜合保稅區規劃方案，采取主動跟進、提前介入、超前服務等措施，與項目建設方建立業務配合、重大事項報告、信息通報和技術協調配合等機制，積極了解和掌握項目引進、建設對檢驗檢疫工作的要求，及時把工作重點調整到服務北部灣經濟區開放開發上來。