在西部哪個城市中，也沒有重慶市的國際貨運代理業興旺發達。“三峽蓄水后，我們代理的集裝箱越來越多，給重慶摩托車出口帶來的很大的方便。”重慶中外運一位專門代理摩托車外運出口的李先生表示，“三峽蓄水也給我們帶來了副作用———水運貨代市場競爭太激烈了。”
　　三峽蓄水以來，由于航道條件改善，給重慶市貨物外運帶來了巨大的便利。重慶市目前90%以上的外貿物資通過水路運輸完成，水路貨運周轉量占重慶全社會總量的68.41%，居綜合運輸體系第一位。
　　水運優勢進一步發揮正在進行175米試驗性蓄水的三峽工程蓄水進展順利，截至10月27日18時，三峽壩前水位為170.82米，比9月15日起蓄時的145.87米上漲了近26米。
　　由于內河水運具有運能大、運距長、能耗小、成本低、占地少、污染輕的比較優勢，近年來，水運對重慶市及西部地區社會經濟發展的服務能力增強。尤其是三峽蓄水后，長江航道變深，刺激重慶庫區水路運輸生產的快速發展，船舶大型化、專業化、標準化趨勢日益明顯。
　　據重慶市港航管理局介紹，重慶市汽車、摩托車、裝備制造、石油天然氣化工、材料工業等支柱產業的大宗物資運輸主要通過水路，對水運依存度越來越大。內河水運為支柱產業提供的低成本物流平臺，加快了生產要素聚集，形成了重慶市臨港產業集群和沿江產業帶，集中了全市約95%以上的冶金、機械制造和化工企業、95%以上的電力企業、100%的水泥企業和100%的造紙企業。
　　據了解，重慶載貨汽車滾裝在2000年開始出現，并得到快速發展，年營運收入由不到2億元，增長到現在的近10億元。重慶市港航管理局運輸處副處長黃昌頓介紹說，以往重慶汽車生產企業通過水運，將商品車運往長江下游時，一艘船僅300個車位，現在隨著船舶大型化，一艘船有800~1200個車位。2008年，重慶化危品專業運輸企業發展到34家、152艘船舶、26.3萬載重噸，年產值3.8億元。
　　由于大力發展標準化集裝箱、滾裝船、油船及化學品船等優質運力，截至2008年底，重慶船舶總運力達356萬噸，是2002年的3.9倍，全市貨運船舶平均噸位由2002年的301噸，增加到2008年的1300噸，長江干線達到1400噸以上。
　　快班輪五天到上海自金融風暴發生以來，重慶市外貿集裝箱吞吐量極速萎縮，今年2月份吞吐量最達到最低點，僅為1.7萬標箱。“這不是重慶水運的問題。國外買家恢復后，長江水運給重慶外貿帶來的競爭力會進一步發揮。”重慶中外運的李先生說。
　　重慶市港航管理局運輸處副處長黃昌頓介紹說，目前，全球十大集裝箱航運公司全都在重慶設立了代辦處或分公司，使重慶的集裝箱物流業務范圍遍及世界各地。
　　集裝箱運輸在蓄水以來得到了迅猛發展。1993年，民生輪船有限公司開辟了重慶至上海長江集裝箱班輪運輸，開創了重慶集裝箱運輸的歷史。蓄水前，集裝箱船舶僅容100箱左右，現在最高能夠達到426箱。至2008年，重慶市已有14家公司具備經營集裝箱內支線資格，7家公司開班，每周42班。
　　重慶直達上海外貿集裝箱“五定”快班輪2007年8月正式開通，這是重慶著力打造長江上游口岸物流中心的又一舉措。“五定”快班輪是指按照定港口、定航線、定班期、定運時、定船舶的“五定”運作模式，由重慶港始發至上海港的一船到底的外貿集裝箱快班輪。目前，民生、太平洋、重慶中遠、重慶中外運和長航公司作為首批快班輪運營船公司，每周共開行10班，全程運行時間144小時，誤差不超過6小時。
　　快班輪中途不做任何停留，而普通集裝箱貨輪需要8-10天左右。目前，首批快輪運營船公司包括民生、太平洋、重慶中遠和長航等，每周10班，全年共開通520個航次。
　　為確保快班輪規范運行，重慶市政府口岸辦研究出臺優惠政策，對枯水期開通快班輪給予扶持；重慶海關和重慶市檢驗檢疫局進駐寸灘港，每周7個工作日對快班輪貨物設置專用通關通道，采取優先受理、優先查驗、優先放行的“三優先”便利通關措施，確保報關、報檢、驗放通關流程4小時內完成，使每一個集裝箱平均在港時間由過去的3天以上縮短為1天；港航局積極協調三峽通航管理局，對快班輪實行始發申報、優先過閘，并通過GPS定位系統實施全程監控，確保快速、安全、準點抵達上海港；寸灘港推出“快速、優質、優先”等10項集裝箱港口作業優質服務承諾，保證港口24小時全天候作業，快班輪裝卸作業時間不超過8小時，準點率達到100％。
　　從今年5月份起，重慶市外貿集裝箱吞吐量與去年同期的降幅基本穩定在12%~15％之間，這也反映出目前重慶市外貿集裝箱吞吐量已經趨于穩定。預計全年外貿集裝箱吞吐量可達到26.5萬標箱，全年同比下降幅度在10%左右。
　　進一步疏通黃金水道日前，交通運輸部長江航務管理局和重慶市交委簽署共建協議，務求以最快速度打造“黃金水道”，加快重慶長江水運發展。
　　重慶寸灘港是長江中上游最大的港口。一期工程3000噸級泊位2個，年吞吐能力20萬標箱，二期工程完工后，將實施寸灘港區三期工程，規劃建設泊位4個，新增集裝箱通過能力56萬標箱。此外，重慶市東部新城正規劃修建物流能力百萬標箱級的綜合性港口。到2012年，寸灘二期工程已經完工投入使用，再加上果園港的一期工程完工、九龍坡港口、萬州港、涪陵港等一起，重慶港的年集裝箱吞吐能力將有可能達到200萬標箱。重慶港周邊航運體系完善、發達，能保證集裝箱隨到隨走。
　　目前，重慶港堆場面積有限，九龍、寸灘堆存能力已達到過飽和狀態，嚴重影響了港口的發展，制約了港口運營能力的提升。
　　據悉，在簽署共建協議后，重慶市將加強港口總體規劃管理，加快沿江主要港口建設，特別是集裝箱、化危品、滾裝等專業碼頭的建設。長江航務管理局則將加強對長江干線航線的治理，適時開展庫尾航道的研究和治理工作，保護航道資源，改善通航條件。
　　此外，雙方還將共同推進長江干線及三峽庫區標準船型的研發和推廣，著力推進船舶標準化、大型化、專業化。市交委也會加快現有非標準船型和老舊落后船舶的更新改造和淘汰。
　　10月20日，交通運輸部水運局召集有關重慶市港航管理部門、協會和企業召開會議，專題研究長江載貨汽車滾裝船運輸安全管理等有關事宜，明確提出非標準載貨汽車滾裝船分批退出三峽庫區運輸市場。
　　自2006年9月建成并投入使用，已經完成近50萬臺滾裝車輛翻壩轉運任務，并為當地移民提供200多個就業崗位。