近年來，云南加快實施部分航道治理、港口建設、船型標準化、運輸擴能、水運保障等工程，進一步加快航運建設步伐，著力打造“兩出省、三出境”水運通道。 
    云南地跨六大水系，擁有金沙江、瀾滄江、紅河、南盤江、怒江、瑞麗江等６條干流及其支流６３條，主要河道長１４０００多公里，可開發利用的航道有８０００多公里。北有金沙江直通長江，東有右江連接兩廣，南有紅河、瀾滄江深入東南亞腹地，西有瑞麗江—大盈江—伊洛瓦底江，經緬甸而不需經馬六甲海峽就直出印度洋，上述河道的開發可以有效彌補陸路交通的不足，緩減出省物資運輸的瓶頸制約。 
    近年來，云南省抓住全國航運建設大發展有利時機，加大了金沙江、珠江國內航道建設，并積極與周邊國家合作，不斷推進瀾滄江—湄公河大通道建設，推進中越紅河航運開發。抓住水富港已確定為長江航運第一港和水麻高速公路的建成通車機遇，加快水富—宜賓段航道整治，力爭把水富港建設成為云南連接長江流域及“長三角”的重要物流中心，實現水陸空聯運省際物流大通道。同時，積極推進右江百色水利樞紐通航設施建設步伐，力促百色水利樞紐１０００噸級過船設施建設盡快開工，確保珠江水運通道上下貫通，加緊富寧港建設步伐，使右江—珠江成為云南通往珠三角地區，進入南海的重要水運大通道。在瀾滄江—湄公河已實現下游四國正式通航的基礎上，進一步改善境外航道通航條件，加快航運基礎設施建設，豐富物流品種，提高航運效能，力爭早日把瀾滄江—湄公河大通道建設成云南省連接東南亞、南亞地區重要的國際物流大通道。 
    不久前，昆明至水富、昆明至羅村口高速公路全線建成投入使用，金沙江航道與公路結合形成了更加暢通、快捷的水陸聯運，省內貨物可以快速在水富港集結，裝船后直達上海；百色水利樞紐過船設施建成后，云南物資可以就近在富寧港下水出兩廣，通達港澳地區，這將實現云南交通資源的有效配置，極大促進云南省與長江三角洲、珠江三角洲的經濟往來。目前，中國—東盟自由貿易區各項政策正逐步到位，中、印、緬、孟，中越“兩廊一圈”區域經濟合作也在加速推進，云南省參與大湄公河次區域經濟合作不斷加深。今年，瀾滄江—湄公河云南境內景洪港至中緬邊境２４３號界碑７１公里河段的通航能力大幅提高，適航船舶噸位已由原來的１００噸提高至３００噸，這緩解了區域內貨物運量不足、運輸成本不斷上漲壓力，促進了區域內經濟的不斷升溫。