據杭州海關統計，2007年2月到2008年5月，杭州出口加工區已有5家企業退區或有退出意向。這一現象在以前很少出現。據調查，退區企業增加是多種原因造成的。  　　配套加工類企業因龍頭企業出口減產，導致經營困難而退區。這類企業產品結構相對單一，企業間相互依存度較大，容易產生聯動效應。比如，今年來，出口加工區龍頭企業東芝公司海外訂單明顯下降，今年1—4月出口筆記本電腦33萬臺，同比下降37.7%。受此影響，“凱寧包裝”和“新進電子”兩家為東芝配套加工包裝箱和光盤的企業訂單驟減，不得不退區。  
　　區內政策單一，功能尚未完善，企業因發展受限而要求退區。根據國家政策規定，區內企業只能從事加工，不得做其他業務，導致設計、檢測、物流等功能缺失。如區內企業不能正常處理在實際加工過程中產生的剩余原材料，使企業的經營成本明顯高于區外同行；不能進行正常的產品售后維修，致使企業不能向客戶提供應有的服務。這些限制影響了企業的經營和競爭能力，有的企業便產生了退區的意向。  
　　部分中小企業的物流特征不能適應國家對出口加工區的特殊監管需要，造成成本偏高而退區。杭州出口加工區地處內陸，區內企業進出口貨物必須在主管地海關報關后轉關運輸，而目前轉關車輛運費遠遠高于普通車輛。如準備退區的企業“永正稱重”，出口量少批次多，進出區頻繁，造成單位運輸成本較高。經核算，僅這一項，該企業在2007年就多支出費用30多萬。  
　　為此，海關建議：加快出口加工區保稅物流功能拓展試點進程，實現物流功能疊加，努力建成集加工制造中心、研發中心、物流分撥中心等為一體的綜合型區域；優化招商引資辦法，注重招商引資的工作實效，爭取吸引更多“兩頭在外”的優質企業進駐加工區；爭取以“屬地報關、口岸驗放”模式代替目前的轉關運輸，既嚴密監管又方便高效，加快物流通關效率，進一步顯現加工區優勢；積極推進加工區試點工作總結，完善相關政策，更好地為企業提供合理、合法的服務。