據廈門海關消息，為準備好海滄保稅港區2009年初封關運作，在國務院批準設立海滄保稅港區后，廈門海關迅速集中一批業務骨干投入緊張的海滄保稅港區監管方案的制定中。按照海滄保稅港區的總體規劃，其區域內既有大型集裝箱碼頭，還有已建的出口加工區和物流園區，道路縱橫交錯，功能紛繁多樣，其海關監管方案的復雜性和困難度甚至超過了國內其他保稅港區。經過對上海洋山港、天津東疆港等保稅港海關監管方案的學習、考察和借鑒，廈門海關在短短的兩個星期內迅速拿出了監管草案，為海滄保稅港區的早日封關運作走出了堅實的第一步。 　　廈門海關加工貿易處有關人士告訴記者，海滄保稅港區運作后，海關還將采取多項便利措施，支持港區的發展。如實行集中申報，經海關核準，區內企業可以對1個自然月內的申報清單數據進行歸并，填制進出口貨物報關單，在次月底前向海關辦理集中申報手續,比保稅物流園區和口岸的現有管理規定更加便利，能更好適應現代物流的發展需要；區內企業在區外從事對外貿易業務且貨物不實際進出保稅港區的，可以在收發貨人所在地或者貨物實際進出境口岸地海關辦理申報手續，有利于區內企業到區外拓展業務；對于同一配額、許可證件項下的貨物，海關在進區環節已經驗核配額、許可證件的，在出境環節不再要求企業出具配額、許可證件原件；海關對保稅港區內加工貨物不實行銀行保證金臺賬、合同核銷，不執行單耗標準，取而代之的是“以查代核”，使加工貿易手續更加簡便。