兩岸實現“三通”后，通過香港過境的游客和貨物勢必有所減少。而與大陸隔海相望的臺灣省，將與內地展開更多的對話。“三通”對臺灣企業的生存與發展至關重要，兩岸直接“三通”的實現對臺灣經濟的實質貢獻巨大，它有助于減少生產要素成本支出、增進兩岸貨流、提升兩岸企業的競爭力，帶來更多就業機會。尤其是在當前全球遭遇金融風暴、面臨經濟不景氣的情況下，直接“三通”的基本實現有助于兩岸經濟平穩發展。 
　　而對大陸來講，兩岸直航將進一步密切兩岸經貿關系，三通后，相信有更多的臺商來大陸投資，或者將業務范圍擴展至內地。這對于推動大陸經濟發展、解決就業等都具有重要意義。實現直接“三通”是兩岸雙方的需要，是互利雙贏的。對此，臺灣高雄市電子商務協會理事長謝長峻也表示，兩岸的互通是好的開始，大陸經濟規模比較大，臺灣對大陸日用品、商品期待很高，大三通的實現將會帶給兩岸互贏互利的模式。
　　“大三通”將促兩岸電子商務升溫
　　兩岸的全面三通，對于兩岸電子商務發展來說是利好消息。艾瑞咨詢報告認為，“大三通”中關于通郵、通航的協議條款，對于克服兩岸電子商務合作與發展中存在的物流成本高、配送時間長等關鍵問題，將發揮積極作用。這必然會使得大陸銷售的臺灣商品價格下降，從網絡購買到的臺灣商品價格更加便宜。
　　同時，貨物運輸與郵件遞送的時間大大縮短，提高了電子商務的配送效率，更加體現了電子商務的便利性，大陸2.9億的網民與臺灣約1300多萬的網民均成為相互的潛在客戶，更多商品擁有了更多客戶，更多客戶可選擇更多商品，而中國內地購物市場需求旺盛，對臺灣的電子商務企業來講無疑是很大的市場，對于拉動臺灣網絡購物市場發展將會是一個新的動力。
　　電子商務支付手段也將在兩岸三通后逐漸實現對接，大陸買家和臺灣商家之間商品買賣的結算支付更加便捷，大陸消費者可以更方便地用銀行卡直接購買臺灣商品，必將促成交易金額的進一步擴大，而隨著電子商務市場的不斷開發，網購數量的增加，兩岸電子商務企業與網民的交流愈加廣泛之后，網絡普及率達到65.5%的臺灣網購民眾，也將帶動普及率未達20%的大陸網民加速網購進程。
　　臺灣電子商務聯盟、臺灣網際網路行銷研究協會秘書長陳定震也表示，“大三通”的實現將對網絡購物市場產生巨大影響，一是物流成本的降低，會使兩岸的消費者受益；二是使目前在大陸銷售的臺灣商品更加多樣化；三是促進兩岸電子商務人才、技術等方面交流與整合。前臺灣科技大學工業管理系系主任游源淳博士也認為，兩岸的全面“三通”對電子商務特別有幫助，對物流最大的幫助就是海運直航，這將節省很多時間和成本，特別對于一些需要保鮮的產品如水果、水產品非常有幫助。
　　兩岸電子商務合作還需多方努力
　　“三通”的實現，兩岸電子商務合作，為臺灣的網絡商店引入大陸消費者的旺盛購買力，為臺灣的網絡商店帶來了新的商機。同時，也讓大陸消費者可以足不出戶方便快捷地購買臺灣商品，進而了解臺灣。但是目前兩岸電子商務的發展仍需各方的努力。
　　消費者對臺灣的商品認識需要有一個過程，加上網絡瀏覽信息不易，這些都阻礙中國內地使用者的消費意愿。以淘寶網上的“臺灣館”為例，最受歡迎的商品仍為服裝、化妝品、及臺灣特色食品。而且臺灣商品對于中國內地消費者而言，屬于小眾市場，因此對兩岸網絡購物的發展刺激也還需加強。
　　不過，正如臺灣電子商務聯盟秘書長陳定震所言，兩岸電子商務發展各有所長，大陸市場很大，電子商務發展呈現多樣化，且與國際接軌比較強，臺灣接觸商業比較早，在網絡營銷方面的概念及管理相對成熟。通過交流可以實現兩岸的互補，增加兩岸電子商務經濟效益。或許如前臺灣科技大學工業管理系系主任游源淳博士所建議的，兩岸的電子商務需要在金流、物流、技術、人才各方面展開合作，成為戰略合作伙伴，建立戰略聯盟。
　　兩岸的全面三通，已經為兩岸的交流和發展創造了千載難逢的契機，相信兩岸的優勢互補，各方面全方位的合作，必將成為兩岸電子商務的升級和蓬勃發展的助推器。