截至目前，深圳保稅區已有倉儲企業116家，包括國際物流企業和企業集團的跨國采購配送中心。園區的倉儲物流企業已由過去的簡單倉儲業務，發展成為集倉儲、包裝、分撥、配送、物流信息處理等功能于一體的現代物流企業。

　　隨著國際物流企業入駐深圳保稅區，帶來了生產零庫存、網絡訂單、在線結算、供應鏈管理、深度分銷等新型物流管理模式。為了積極適應新型物流業務需求，深圳海關加強對現代物流業功能拓展產生的新型海關監管業務研究力度，對大型物流企業提出的特殊監管需求予以研究，嘗試新型監管模式，實現海關監管與物流企業功能延伸同步發展。

　　去年以來，深圳海關按照“管得住”、“通得快”的原則，進一步完善自動核放系統，修改了“一車多單”網上申報程序，完善了地磅數據和通關數據的邏輯檢控功能，確定了轉關車和空車網上申報、空車短信申報監管模式。一連串的改革，使深圳近萬家企業因此享受到極大的通關便利。