航運、物流及基礎建設小組召集人董建成表示，在政策方向上，小組認為本港應發揮在航空、海運和物流業的發展規模和經驗，提升在這方面競爭力，鞏固作為國際和地區空運、航運及物流樞紐的角色，從而推動本港經濟增長，及配合國家在“十一五”規劃下的發展。
    就有關航運和物流方面的策略建議，小組提出應致力提高跨界貨運的成本效益，包括研究綠色通道的應用及引入內地貨車司機對降低貨運成本的幫助，以及與廣東省當局商討降低跨界貨運牌照的費用，和放寬對粵港跨界貨運合營企業的限制。
    在交通基建方面，小組建議研究成立高層次跨部門統籌協調機制，以制訂整體跨界交通基建發展策略及更有效統籌協調有關的基建項目；應優化跨界交通網絡，以更便捷的方式直接駁通鄰近的綜合交通樞紐，拉近香港與內地的距離，并拓闊香港機場和港口的腹地，以促進香港空運以及鐵路運輸的發展，其中包括積極考慮以“專用通道”方式接駁國家高速鐵路網絡。
    該專題小組共提出了9個策略性建議和27項具體行動建議，惟小組并無討論興建十號貨柜碼頭，并強調興建碼頭須作整體考慮。