貨物在倉庫中先后存放在兩個區，先以整箱或是整托盤為單元存放到保管區，另有一個區域是分揀區，可以將貨物拆箱單件貨物揀取。出庫的貨物先從分揀區揀選，當分揀區的貨物消耗后，再從保管區補貨。該布局方法要先設計兩個區的面積和相對位置，然后再考慮各種貨物在兩個區的存放位置，使貨物的操作費用最少。兩階段布局是一個復雜的布局優化問題。